水田、休耕田や用水路などに生育する抽水性の1年草。ウリカワ-コナギ群集の標徴種。
茎は短く、倒伏する。葉は根生し、高さ10～40cm。
葉身は成長初期は線形、後に長楕円形または倒披針形となり、成葉は倒披針形、卵形、卵状心形と変化に富む。
長い葉柄があり、葉身の長さ2.5～6cm、幅0.7～4cm。基部の托葉は赤紫色を帯びる。
夏に葉鞘からごく短い柄のある総状花序出す。一見すると花序は葉柄の中程から出ているように見えるが、
葉柄と見えるものは鞘状となった総苞の基部付近が花茎を抱いているのであって、葉身と見えるものは総苞である。
花序には2～8個の花がつき、花は青紫色、径1.5～2cm、1日花で数時間しか開花しない。
柱頭は細く先端が3裂し、各片はさらに2裂し、子房は3室ある。
花茎は花後に下垂し、楕円形で長さ7～10mmの蒴果を付ける。種子は0.7～0.8mm。
白花のものをシロバナコナギ（f. albiflora）といい、ごく稀に見られる。
絶滅危惧種として知られるミズアオイ（M. korsakowii）は、花序が直立して葉よりも高くなり、多数の花をつける。
外来種で似たものにアメリカコナギ（Heteranthera limosa）があり、花序には1花だけが付き、花被片は先端がややとがったヘラ形で、
色は青紫色と白色の2型がある。
近似種 ： ミズアオイ、アメリカコナギ
■分布：日本全土 ・ アジア、オーストラリア北部。アメリカとヨーロッパ南部に帰化。
■生育環境：水田、休耕田、用水路など。
■花期：8～10月
■西宮市内での分布：全域に分布するが、平野部には少ない。
青紫色で、外花被片は長楕円形、内花被片は広楕円形。
雄蕊6個のうち1個は長く、開花直前と閉花後に雌蕊が動いて長い雄蕊に触れ、自家受粉するという。
では、短い雄蕊はどのような役割を担うのだろうか？
水田で倒れ込んで結実していたもの。そのためか、下垂していない。花被片は宿存して蒴果表面に張り付いている。
水没した状態でも結実するという。
葉は線形で先はとがる。オモダカの幼葉に似るが、オモダカのほうは広線形で、先は急に狭くなり鈍頭～やや鋭頭。
葉身と葉柄が分化しはじめている。葉柄は斜上するが、葉身は平開気味となる。
成葉直前の個体で、まるで葉身を浮葉のように水面上に浮かべ、水中にある葉柄の基部は太くなっている。
葉は卵形～卵状心形で、多管質の長い葉柄を持つ。
コナギは除草剤に強く、水田ではもっとも手強い強害草である。
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